Bases Moleculares para el Estudio del TNFa en la Artritis Reumatoidea, Glosario

Activación Mitogénica: proceso por el cual se da inicio a la mitosis y división de células somáticas.

Alelos: formas alternativas o variantes que puede presentar cada gen en un individuo.

AP1: proteína Activadora 1, es un producto del gen jun u oncogen que actúa como un factor de transcripción en la expresión génica.

Apoptosis: cambios citológicos relacionados con muerte celular programada, un proceso de activación celular en el cual se observa autodestrucción de la célula eucariota. En este proceso están implicados muchos genes y es completamente irreversible. Útil en la eliminación selectiva de células.

ARNm: es el ácido ribonucléico del tipo mensajero, el cual se encarga de llevar la secuencia de nucleotidos transcritos del ADN hasta los ribosomas,para ser traducidos a proteína.
Asociación no-covalente: son enlaces débiles entre moléculas, en los cuales no se implican gastos o liberación de energía.

AUF1: factor de unión 1 a adenosina y la uridina. Es una proteína de 37 kDa, que s eune específicamente a las regiones AURE. Encargado de la estabilización del ARNm.

AURE: es una región de pentanucleótidos, denominadas como elementos ricos en AU, cuya secuencia consiste de una o más repeticiones en serie de secuencias AUUUA. Se encuentra en la región 3′ no traducida del ARNm. La presencia de estos elementos se relaciona con la vida media del ARN y la incorporación de otras proteínas a su sistema.

AURE-BPs: son proteínas que interactúan con el ARNm para ayudar a su estabilización y buen funcionamiento. Estas proteínas se unen a las regiones AURE, ricas en Adeninas y Uracilos.
Bioactividad: es el conjunto de procesos biológicos en los cuales una proteína (TNF) puede tener participación y una acción importante.

Biosíntesis: síntesis o anabolismo celular, en la cual hay consumo de energía por la generación de macromoléculas como los ácidos nucléicos, y las proteínas

CD14: glicoproteína de superficie, con un peso de 56 kDa, encargada de interactuar con algunas moléculas del sistema inmune, para generar procesos de activación intracelular. Su forma soluble se ha clasificadocomo un miembro de la familia de receptores TNF.

CD40: antígeno de superficie celular, también llamado Bp50, es una proteína de 48 kDa. Es expresada en los Linfocitos B y pertenece a la familia de los receptores TTNF.

Cisteína: aminoácido esencial, clasificado como no polar, el cual es transcrito por los codones UGC y UGU.

Citotóxica: sustancia o molécula que genera muerte o daño celular por liberación de sustancias tóxicas.

CMH: complejo Mayor de Histocompatibilidad, es un grupo de genes ubicados en el brazo corto del cromosoma 6, en el cual se encuentra el sistema HLA o antigenos de los leucocitos humanos, involucrados en el procesamiento y presentación antigénica (HLA Clase I y II) y así mismo posee otros genes como el TNF, factores de complemento, linfotoxinas y proteínas de shock térmico.

Cristalografía: método para el análisis de moléculas complejas, su conformación, enlaces y cadenas; mediante la utilización de la difracción de rayos X a través de ellas.

Deleción: pérdida de un nucleótido, generando una mutación a nivel del ADN.

Desequilibrio de Enlace: fenómeno en el cual un conjunto de genes que se encuentran muy próximos entre sí dentro del genoma, son heredados en bloque de una generación a otra, y raras veces sufren procesos de recombinación.

Epístasis: es la interacción entre genes que se encuentran en diferentes cromosomas, en la cual uno de ellos puede afectar el fenotipo generado por el otro. Generalmente ambos genes se expresan al mismo tiempo.

ERK: proteína quinasa reguladora de señales extracelulares, pertenece a una familia de proteínas altamente conservadas. Encargada de regular las señales celulares en respuesta a mitógenos, además se encarga de fosforilar sustratos exógenos de serina y treonina.

Exones: regiones codificadoras del ADN, que son transcritas a RNAm y finalmente traducidas a proteínas.

Expresión Génica: procesos de activación de un gen, para que a partir de él se genere la síntesis de proteínas.

Factores Trans: moléculas que se unen al ADN o al RNA en sitios previos a una región promotora para ejercer control durante el proceso de transcripción.

G→A: representación de un cambio o sustitución de una Guanina por una adenina a nivel del ADN.

GM-CSF: factor estimulante de colonias granulocito macrófago. Es una molécula estimuladora de la diferenciación y proliferación de líneas mieloides.

Haplotipo: corresponde a una combinación particular de sitios o loci dentro de una región específica de un cromosoma. Podría llamarse un “genotipo en miniatura”.

Haplotipo Ancestral 8.1: combinación de los genes del complejo mayor de histocompatibilidad, en la cual participan moléculas HLA-A1, Cw7, B8, C4AQ0, BfS, C4B1, DR3, DQ2, TNFA (éste corresponde al SNP -308). Esta combinación se ha reportado como un elemento genético importante, asociado a la susceptibilidad tanto de procesos infecciosos como autoinmunes.

HEL-N1: es una proteína de unión a regiones AURE (AURE-BPs), la cual se encarga de estabilizar el transcrito de ARNm durante el proceso de regulación transduccional del TNF.

HuR: es una proteína de unión a regiones AURE (AURE-BPs), la cual se encarga de estabilizar el transcrito de ARNm durante el proceso de regulación transduccional del TNF.

Intrones: secuencias de nucleótidos o regiones no transcritas dentro del ADN, que durante el proceso de trascripción en el paso de ADN a ARNm por un proceso denominado “Splaicing” son excluidas.

JNK: proteína quinasa Just de 130 kDa, esencial en los procesos de señales de traducción para varias citoquinas como el IFN-g y el TNF-a.

Kb: kilo bases, medida de los ácidos nucléicos, dependiente del número de base nucleotídicas que lo conformen.

kDa: kilo Daltons, medida del peso molecular de las proteínas.

Lipogenesis: generación de ácidos grasos y lípidos por procesos metabólicos.

Lipólisis: degradación de lípidos y ácidos grasos a nivel celular, por el catabolismo de grasas.

Lisosoma: organelas celulares, intracitoplasmática donde se dan los procesos de fragmentación y degradación enzimática de proteínas propias y externas.

Locus: región o lugar ocupado por un gen dentro del genoma.

MAPK: proteína quinasa de actividad mitogénica, involucrada en mecanismos de estabilización del ARNm y fosforilación de la tirosina y la treonina como respuesta a señales de activación celular.

Mer: denominación de las bases que conforman una cadena sencilla de ADN.

Microsatélites: regiones polimórficas dentro de un gen, en las cuales se dan repeticiones de dos hasta cuatro bases nucleotídicas n veces.

Monómeros: moléculas conformadas por una sola cadena peptídica, bien sea de hélice a o hélice b.

PAF: factor activador de plaquetas. Molécula de señales de activación.

Pleiotrópico: molécula, proteína o sustancia que tiene afinidad o actua en muchos sitios diferentes de un organismo, o que tiene acción sobre diferentes tipos celulares.

Polimorfismo: variaciones por cambios mutacionales a nivel del ADN, las cuales generan los diferentes alelos de un gen.

Potenciadores: “Enhancers”, son secuencias de ADN que interactúan con moléculas capaces de potenciar o aumentar la expresión de un gen.

Promiscuidad Molecular: es la característica que le permite a un receptor interactuar con varios ligandos diferentes, generando igualmente mensajes diferentes para la célula. Son receptores no específicos en apareamiento pero si en función.

Promotor: es la región dentro del ADN encargada de regular e incluir los procesos de Replicación trascripción y traducción de un gen.

Prostaglandina: son proteínas de señal celular, las cuales pueden generar respuestas como la contracción de la células del músculo liso.

Proteasas: son enzimas encargadas de la lisis de proteínas, lo que lleva a la generación de aminoácidos individuales.

Proteínas con Dominio Mortal: son proteínas que poseen residuos capaces de interactuar con moléculas de señal que inducen a la célula a un proceso de apoptosis o muerte celular.

Represión de la Traducción: es un proceso en el que se da la unión de proteínas represoras al ARNm, generando una inactivación del transcrito y evadiendo la síntesis de proteínas a nivel ribosomal.

Residuo: segmento protéico, cuya secuencia de aminoácidos tiene una posición y una función específica dentro de la molécula. En algunas ocasiones es importante en la interacción proteína-proteína.

Restricción de la Expresión: conjunto de procesos en los cuales la célula recibe la orden de no traducir un gen a proteínas, a pesar de que ya se haya generado el proceso de transcripción.

Reumatología: especialidad de la medicina en vía de expansión. Definición pendiente.

RFLPs: polimorfismo en el tamaño de los fragmentos de restricción, es un método para la detección de mutaciones o alelos dentro de un gen, dados los cambios en los tamaños de fragmentos de ADN, generados por el corte con enzimas de restricción específicas para una secuencia génica definida.

RRM: es una familia de proteínas denominadas Moléculas relacionadas al ARNm, cuya función está dada por la unión a regiones del ARNm durante los procesos de señalización y control de la traducción génica.

RTNF: receptores para el TNF, son proteínas de superficie celular que se encargan de reaccionar con ligandos como el TNF-a y TNF-b. Pertenecen a una familia de receptores celulares denominada TNF.

Señales de Traducción: es el conjunto de vías por las cuales una célula se comunica con otra para enviar un mensaje. Esto se logra por intermedio de receptores proteínas, una célula efectora y una célula blanco.

Silenciador de traducción: molécula encarcada de generar una señal que induce a la célula y a su maquinaria ribosomal una suspensión en la traducción de un ARNm a su respectiva proteína.

SNPs: polimorfismos de nucleótidos simples. Regiones del ADN donde se generan mutaciones que involucran la sustitución, deleción o adición de un solo nucleótido.

STPRs: repetición de secuencias Tandem o continuas en el ADN, se observa una región en la cual se repiten uno o dos nucleótidos n veces.

Superfamilia: grupo de genes que a pesar de que no son homólogos, se relacionan por las características de los dominios que codifican para la generación de proteínas.

TACE: enzima convertidora de TNF-a, es una metaloproteína encargada de producir cortes a nivel del residuo 76 de la molécula inmadura del TNF-a, para generar finalmente la forma madura de la molécula.

TIA-1: proteínas de unión a las regiones AURE, encargadas de regular la traducción del ARNm de algunos genes como el TNF.

TIAR: proteínas de unión a las regiones AURE, encargadas de desestabilizar la traducción del ARNm de algunos genes como el TNF.

Traducción: proceso por el cual la información genética contenida en el ARN se transfiere a proteínas mediante grandes maquinas formadas por varias subunidades denominadas ribosomas.

TRAFs: son factores asociados al receptor del TNF. Corresponden a un grupo de proteínas que conforman la superfamilia del TNF y que se asocian con sus receptores para interactuar en las señales de activación celular.

Transcripción: es el proceso en el cual se da separación de la doble hélice del ADN. Una de ella sirve de molde para que la enzima transcriptasa reversa se acople y comience a generar el ARNm.

Transcrito: es una cadena de ARN en crecimiento que se genera a partir del proceso de transcripción por apareamiento de entre el ADN molde y el ARN naciente con la enzima transcriptasa reversa como intermediario.

TTP: tistetraprolin, es una proteína de enlace al ARNm, perteneciente a la familia de las proteínas con dedos de cinc, denominadas CCCH, conformada por tres cisteínas y una histidina.

UTR: son regiones dentro del ADN que no son traducidas durante el proceso de lectura de la polimerasa, para el paso de ARN a proteína.

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